テストありがとうございます。binフォルダー以外は必要ありません。
Windows 7(64bit) で同様の現象を確認しました。LinuxとWindowsとは違うんだなと思い、公式ページを確認。確かにバイナリはWindows用とLinux用とは別になっています。Windows用バイナリ opensim-0.9.1.1をダウンロードし試しました。
公式のWindowsバイナリ opensim-0.9.1.1でも、OpenSim.exeは同じように停止します。
Linuxのことしか私は分からないので、ここのところは Windowsで opensimを運用されている方に譲ります。すみません。